吴军在三国志战略版的水战体系中具有显著优势，其核心武将如周瑜、陆逊、吕蒙等均具备高水军适性。选择战船时需综合考虑武将特性、战术需求及战场环境。吴国武将普遍拥有S级水军适性，这使得他们在水战中能发挥最大战力，因此优先选择能强化主动战法的战船配置。
蒙冲是吴军前期快速突袭的首选，其高移动速度适合执行闪电战术。该船型能有效配合周瑜的神火计或陆逊的灼烧效果，通过高速机动抢占关键水域。斗舰则更适合中后期大规模会战，其平衡的攻防属性可支撑持久作战，尤其适合搭载鲁肃这类辅助武将，为团队提供稳定续航。楼船虽火力强大但机动性较差，仅推荐在特定攻坚场景中使用。
战船改装方面，神行特性可进一步提升蒙冲的机动优势，适合用于穿插敌方防线或快速支援。若以斗舰为核心，则建议选择强攻改装，通过消除敌方连舫效果来压制对手。对于侧重防守的阵容，坚守改装能显著提升驻守效率，配合程普等防御型武将形成坚固壁垒。需注意改装效果需队伍回城调整，因此需提前规划战术节奏。
武将操练系统能突破固有适性限制，建议优先将孙尚香、凌统等非传统水战武将的水军适性提升至A级。技术选择上，接舷战可增强爆发伤害，特别适合搭配甘宁等高爆发武将。渡江提供的隐身机制能创造战术突袭机会，而巡航技术则适合长时间水域控图。这些技术组合能使吴军在不同作战阶段保持压制力。
实战中需根据敌方阵容动态调整配置。面对魏国器械队时，蒙冲配合接舷战可快速突破防线。遭遇蜀国弓兵主力则宜用斗舰维持阵型，通过风助火势等战法进行消耗。水寨建设应优先升级造船工坊，缩短战船生产周期。资源分配上要保持木材储备，确保战时能快速补充损耗。
吴军战船体系的核心在于发挥高速机动与火攻联动的优势。通过精准的武将搭配、改装选择和技术应用，能在水域战场形成多层次打击体系。需注意保持至少两支不同特性的船队，以应对复杂战场变化，同时避免过度依赖单一战术导致被针对性克制。
