成吉思汗战役是帝国时代2中极具挑战性的战役系列，玩家需要指挥蒙古军队完成从统一蒙古各部到西征花剌子模的六场关键战役。战役核心在于充分发挥蒙古文明的骑兵优势，尤其是蒙古突骑的高机动性与草原枪兵的克制能力，同时注重资源调配与快速扩张的节奏控制。蒙古军队以轻骑兵、骑射手和攻城武器为核心兵种，需根据每关敌方兵种特点灵活调整战术组合。
战役第一关统一各部是典型的资源整合任务，玩家需通过完成各部落的特定要求来获得盟友与兵力支援。克烈部需要20头绵羊，维吾尔部要求击杀东方的狼群首领，泰赤乌与乃蛮部则互为敌对需选择一方征服。优先完成克烈部任务可获得僧侣支援，这对后续收集圣物至关重要。本关关键在于合理分配初始骑射手与轻骑兵，利用地形优势逐个击破任务目标，最终集结全部落兵力围攻西辽。
复仇人生关卡要求玩家在人口限制下抵御西辽进攻并击杀叛徒屈出律。开局需迅速建立防御工事，利用箭塔与城墙延缓敌军攻势，同时训练骆驼兵克制敌方骑兵。屈出律会在地图西北部基地活动，建议组建精锐骑兵小队绕开正面战场直取目标。若选择强攻西辽主基地，需注意其步弓手与轻骑兵的混合编队，优先用骑射手消灭远程单位。
第三关进入中国呈现多线作战特点，需同时应对西夏、金朝与宋朝。快速夺取河对岸的工程师基地可获得手推炮支援，这对攻破长城防线至关重要。金国城池防御严密，建议在其东方建立分基地持续施压，利用蒙古突骑骚扰经济。当敌方开始建造奇观时，必须集中投石机与冲锋车发动总攻。此阶段需保持资源平衡，木材与黄金的持续供给是维持骑兵军团的关键。
西征花剌子模的关卡考验突袭与刺杀战术。初始阶段应全力发展上下两处基地，贸易车队按既定路线行进触发刺杀事件。库曼与俄罗斯会从不同方向发动进攻，需在关键隘口建造城堡防御。花剌子模军队以战象与骑射为主，需大量生产草原枪兵配合僧侣转化。当沙阿被刺杀后，敌军会陷入混乱，应抓住时机两路夹击其主城。
最终关卡蒙古太平要求玩家在速不台援军抵达前击溃匈牙利。初期需在桥头高地建立城堡防御，利用狭窄地形消耗敌军。经济稳定后应迅速过河建立前沿基地，蒙古突骑配合打包机的组合能有效摧毁敌方城堡。注意波希米亚的步兵军团会频繁骚扰，需保留部分草原枪兵作为机动防御力量。当敌方主力被削弱后，集中兵力攻破主城即可完成整个战役系列。
