神秘工厂是失落的方舟中一个需要解谜与战斗结合的副本任务，玩家需通过触发机关、击败敌人并完成特定互动才能推进流程。进入工厂后，首先需在道路尽头的雕像前演奏共鸣之歌，激活传送机制进入下一场景。随后会遇到假人机关，需反复调查假人直至其活动，击杀后通道开启。部分机关需要与环境互动，例如攀爬特定柱子或按下场景中央的开关，需注意NPC对话提示。
工厂内部存在多个隐藏设备，需在特定位置反复交互才能触发。例如场景中间区域需多次查看，共需激活四个秘密设备才能解锁控制室。部分设备位置隐蔽，需仔细观察环境细节。全部设备触发后，二楼NPC会提示控制室门已开启，需前往地图最上层进入。控制室内设有钟楼机制，敲钟后从后方通道离开，继续前进即可完成任务目标。
战斗中需注意工厂内的特殊敌人，如假人激活后具备高攻击性，建议优先清理。部分场景会刷新增援怪，需合理利用AOE技能控制场面。BOSS战前建议保留爆发技能，应对高血量目标时需注意走位躲避范围攻击。副本内部分机关与战斗关联，例如某些敌人死亡后会掉落关键道具，需及时拾取以解锁后续区域。任务最终阶段需沿出口路径直线推进，剧情结束后自动完成逃出生天目标。
