明日之后中稀有宝箱主要分布在各个地图的特定区域，包括海湾之星、愚人码头、人去楼空、无言伟大、熔岩余烬等地点。这些宝箱能开出高分子涂层、战术护木、配方残页等珍贵资源，对装备制作和金条积累至关重要。不同宝箱的刷新机制存在差异，部分为定点刷新，部分则随机出现，需要玩家掌握具体坐标和寻找技巧。
愚人码头的宝箱为定点刷新，位于地图右下角水中，坐标867,-6972，站在码头即可清晰看见。人去楼空的宝箱分布在废弃村落五栋房屋内随机刷新，需注意房屋内感染者的攻击。无言伟大的宝箱在地图中央方碑角落，坐标-288,-2447，需通过弹药箱或喷气背包跳跃获取。熔岩余烬的宝箱刷新范围较广，集中在地图中央被岩浆侵蚀的城区屋顶，建议选择火山未喷发时搜寻。
快乐101区域的宝箱分布具有特殊性，市政厅楼顶、集市货堆、餐厅收银台和商会二楼楼梯平台是主要刷新点。其中餐厅宝箱需下雨天才会出现，商会宝箱偶尔会刷新到三楼房间。沙石堡的重度感染区有四个特殊宝箱，能开出高分子涂层和薄膜面料，中心古堡二楼平台则产出配方残页。秋日森林的宝箱多分布在河流、断桥及燃烧房屋附近，空投箱可呼叫获取滴血红钻等资源。
乌茨矿场的宝箱集中在建筑群和帝国据点，包括神秘宝藏和军资箱等类型。建筑群内怪物密集，建议组队或使用无人机引怪。军资箱位于据点楼梯墙根处，位置隐蔽需仔细搜寻。茅斯沼泽的宝箱如劫后余烬、隐居者的赠礼等分布在右上角瀑布、黑泉镇祭坛等区域，部分需对抗双枪信徒等强力敌人。海底宝箱共有8个隐藏点位，需驾驶探险船前往特定海域探索。
