武将组合的选择直接影响队伍的整体实力和战斗表现。合理的搭配需要考虑武将属性、战法联动、兵种适性以及阵营加成等多方面因素。核心思路是围绕主将构建互补的副将体系，确保输出、控制和续航能力的平衡。高爆发武将需要搭配能提供先手或保护的辅助，而肉盾型武将则更适合与持续输出或治疗型角色组队。
部分剧本或势力特性允许仅上阵两名同阵营武将即可激活属性加成，这为阵容搭配提供了更多灵活性。蜀国的刘备、关羽、张飞组合能激活桃园结义效果，而群雄阵容则可通过登庸令实现跨阵营协作。战械和特殊战法的加入进一步丰富了战术选择，例如刘备的木兽擅长持续灼烧，而袁绍的弩车则适合远程压制。
S级适性武将能发挥兵种最大潜力，而A级适性需通过战法或宝物弥补差距。骑兵适合快速突进，盾兵侧重防御，弓兵则依赖远程输出和控场。组合时应避免兵种被克制，例如弓兵队伍需警惕骑兵突袭，可通过搭配枪兵副将提供反制手段。战法联动尤为关键，例如控制类战法配合高爆发输出能快速削减敌方兵力，而减伤和恢复类战法能提升队伍的持久战能力。
前期推荐使用低统御值的菜刀队或稳定输出组合，如孙策、关平等物理武将，依赖普攻和简单战法降低战损。后期则需根据对手配置针对性调整，例如面对高谋略队伍时可加入法系免疫或高智力武将。转型过程中需注意资源分配，优先培养核心武将的等级和战法等级，避免因盲目更换阵容导致战力断层。
