研究协议是游戏内提升舰船科技的重要功能，每天可签署5次，需在研究界面底部进入。选择合作企业和研究方向后即可激活协议，不同路线会影响蓝图产出类型。研究协议藏在游戏主界面左侧的研究按钮内，点击后会看到底部有一个研究协议选项。进入后会发现每天有5次免费签署机会，签署时需要从安东尼奥斯、木星工业等合作企业中选择一方，再挑选战机护航艇火力出众等研究方向。每次签署后需等待冷却时间，但协议不会自动执行，需要手动点击开始研究才会消耗机会。
游戏内研究方向分为直射武器、投射武器、战机护航艇等大类，每条路线对应不同的舰船蓝图池。比如选木星工业+直射武器+战机护航艇可能产出新大地或孢子战机，而安东尼奥斯+直射武器+火力出众则可能出维塔斯B或星云脉冲。也可以偏好优先选择能产出防空舰船的路线，因为这类蓝图在中期战斗中实用性更高。
签署协议时会消耗白点（游戏内货币），但首次签署必得未拥有的蓝图。如果重复获得已有蓝图，会转化为5点技术值用于强化舰船。建议优先完成每日协议次数，因为未使用的次数不会累积到第二天。研究协议的结果受赛季进度影响，第二赛季后开放定向协议功能，可锁定特定舰船类型进行研发。
